Μια από τις καταστατικές αποστολές του Ι.ΔΙ.Σ είναι η δημιουργική σύνθεση βασικής έρευνας και εφαρμοσμένης πολιτικής. Σε αυτό το πλαισιο, από το 2013, το Ινστιτούτο συνδιοργανώνει με τη Σχολή Εθνικής Άμυνας (ΣΕΘΑ) το Ετήσιο Συνέδριο Ελληνικής Υψηλής Στρατηγικής. Οι θεματικές του προσαρμόζονται κάθε χρόνο ανάλογα είτε με τις τρέχουσες προκλήσεις είτε με τις μακροπρόθεσμες τάσεις που αντιμετωπίζει η Ελλάδα όσον αφορά την εθνική ασφάλειά της.